Author Archives: wangleheng

生物信息和创业

  都知道我患有轻度创业妄想症,痴迷收集各种白手起家的离奇故事,狂热鼓动周围所有合适不合适的朋友下海。可俺手头的工作叫生物信息,传说中最阳春白雪,让热血青年丧失注意力的一种罕见菌类,哦不,我是说一种罕见学科。

  所以俺总在饭碗和理想之间寻找联系。

  以前就写过BLOG,猜测生物信息领域未来最可能的杀手应用。里面提到的23andMe其实是Google创始人的新婚妻子创建的。(Google两个创始人几乎同时结婚,娶的都是搞生物信息的博士)。今天在科学松鼠会看到一篇以玩笑口吻撰写的创业计划。笑过以后提醒你,并没有看起来那么荒谬,目前硅谷VC资助的生物信息创业公司,基本也就是这些路数。

  关于扫描基因取得个人倾向,05年想到时还很兴奋。其实已是老生常谈。电影GATTACA里性感美女谈恋爱的标准模式,就是拔根头,然后留下联系方式,“如果对我感兴趣,打电话”。你可以拿着头发去医院里算命:如果有孩子,得心脏病的概率是多少。

  BTW:伦理问题不是工程师的范畴,让哲学、社会学和法律专业的兄弟姐妹去头疼吧。最坏情况下,出现基因专利和昂贵的定制基因服务,就像刘慈欣《赡养人类》里的一号文明一样,富人和穷人逐渐演变成不同物种。

关于卡夫卡

  (这篇BLOG十天前就想写下来。明天起软件开发和测试又要忙起来,趁脑袋里印象还没变淡赶紧敲)

  读过《变形记》,就知道以后再读卡夫卡的书必须要做好充分心理准备。即使心情最灿烂时翻开,也可能迅速被绝望和抑郁吞没。

  如果在网上搜索卡夫卡,赞誉的话车载斗量。最近好几届诺贝尔文学奖得主都喜欢卡夫卡。我最喜欢的中国作家王小波和余华,也自称深受卡夫卡影响。周围的文科朋友,只要提起卡夫卡,话题就特别多。

  作为理工科出身的业余文艺虫子,没啥独立观点,只懂附庸风雅。于是数次试图强攻《城堡》,均半途而废,用“不忍卒读”形容绝对恰当。心智不够成熟坚强,朽木不可雕也。

  《布鲁克林的荒唐事》里有这么一段,再次鼓起了阅读卡夫卡的勇气。

  这是卡夫卡生命的最后一年,他已爱上了年轻的姑娘多拉.戴芒特,她只有十九或二十岁,是从她在波兰的犹太教哈西德教派家庭里逃出来的,现居柏林。她只有他的一半年纪,但就是她给了他离开布拉格的勇气——他想做这件事已有多年,她是第一个、也是唯一同他生活在一起的女人。一九二三年秋天他移居柏林,第二年春天就死了。尽管他健康恶化,尽管柏林的社会状况很糟:物品匮乏,政治暴乱,德国历史上最严重的通货膨胀,尽管他无疑知道自己已不久于人世,可这最后的几个月也许是一生中最快乐的时光。

    每天下午,卡夫卡出去到公园里散步,多拉常常陪他一起去。有一天,他们遇见一个小女孩在伤心啜泣,涕泪涟涟。卡夫卡问她怎么啦,她说她的玩偶不见了。他马上就编了一个故事,告诉她是怎么回事。“你的玩具娃娃旅行去了,”他说。“你怎么知道?”她问。“因为她给我写了一封信,”卡夫卡说。小女孩看来不大相信。“你带着信吗?”她问。“没有,对不起,”他说,“我把信留在家里了,我做得不对,但明天我会带来。”他说得那么可信,那小女孩便不知道再多想什么了。这个神秘的人说的是真话,这是有可能的吧?

    卡夫卡径直回家写信。他在书桌旁坐下,多拉看着他写信,她发现他的神情就像平时写作时一样认真,紧张。他不是要骗那个小女孩。这是真正的文学劳作,而他决心把它写好。如果他能编造一篇美丽而有说服力的谎言,这就会弥补小女孩的损失,尽管写的是不同的现实,甚或是虚假的现实,但根据虚构法则,这是真实可信的。

    第二天,卡夫卡带着信急急忙忙赶去公园。那小女孩在等他。由于她还不识字,他便把信大声念给她听。那玩具娃娃非常抱歉,因为所有时间都跟同样的人生活在一起,她感到厌倦,她要走出去看看世界,去交新朋友。不是她不爱小女孩,而是她渴望换换风景,所以她们得分离一段时间。然后娃娃答应每天给女孩写一封信,让她及时知道她所做的事情。

    这故事就在这里开始打动我的心。卡夫卡不嫌麻烦写地一封信就足以令人吃惊,不料现在他又要自己承担每天写一封信的责任——不为别的,只为了要安慰这个小女孩,而他和她素不相识,只是一天下午在一个公园里偶然碰见了她。什么样的人才做这样的事?他连续写了三个星期的信。内森,三个星期。他是最卓越的作家,生活中从不浪费时间——对他而言时间已经越来越少而显得更珍贵——他却还代为一个丢失了的玩偶虚构书信。多拉说,他每写一句都为细节苦思冥想,其文笔明晰、有趣而引人入胜。给那女孩念不同内容的信。玩偶长大了,上学了,认识了别的人。她继续要小女孩相信她爱她,但也暗示说,生活中某些复杂因素使她不能回家。一点儿一点儿地,卡夫卡让小女孩做好心理准备,知道玩具娃娃将永远从她生活中消失的时刻就要来临。他竭力要写出一个满意的结尾,担心如果写得不成功,这魔力就将失效。试过多种可能后,他最后决定把玩偶嫁出去。他描述了她爱上的年轻人、订婚派对、在乡下举行的婚礼,甚至还有玩偶和她丈夫现在住的房子。然后是最后一行字,玩偶向她心爱的老朋友告别。

华盛顿纪念塔上的清朝宁波知府题字

  端午节期间看完了易中天的《费城风云》,立宪会议的唇枪舌战很有意思。

  附录列出55名代表的生平事迹,有关乔治·华盛顿的一段比较好玩:1848年兴建的华盛顿纪念塔,有块高61米、宽1.2米的中文碑,是当时清朝宁波知府毕永绍题写的,碑文引述前福建巡抚徐继畲的《瀛寰志略》内容,最后几句是这样的:

  “美利坚合众国以为国,幅员万里,不设王侯之号,不循世及之规,公器付之公论,创古今未有之局,一何奇也!泰西古今人物,能不以华盛顿为称首哉!——大清国浙江宁波府镌,耶酥教信辈立石,咸丰三年六月初七日。”

  搜索一下有关历史:赠碑时,徐继畲已被罢官了。赠碑不到三个月,毕永绍也从宁波知府的职位上离任。1862年,洋务派建立外交部,徐继畲复职为三品京堂,美国总统特别委托国务卿,请艺术家绘制一幅华盛顿画像,远涉重洋,命美国驻华公使赠给徐继畲。

新闻批注

  中星9号直播卫星终于赶在奥运会之前发射成功。卫星采用我国自主的ABS—S和AVS技术标准

  研发成果实际用起来,才是工程师最大的价值体现。

  发表论文,申请专利,建立标准……最终在国计民生重要环节(例如:中国首颗电视直播卫星上的视频信源编码标准)发挥关键作用(例如:直接为奥运转播服务,卫星有47个频道,那么每年节省上千万美元的MPEG4专利费)。有机会把整个链条走完是种幸福。向曾经和正在参与AVS标准研发的弟兄们致敬。

  攀亲戚:好歹俺也曾借调到AVS课题组做过一星期的手机播放器界面呀,嘿嘿。

  借机抒情一把:pFind任重而道远,俺将上下而求索。

《三体II:黑暗森林》

  前天买到了刘慈欣《三体II:黑暗森林》,一晚上就看完了。

  之所以吓人,是因为“两条基本公理和由此形成的推论”的确显得很有道理。星际文明之间的抑制甚至毁灭,与罗伯特·J·索耶的《计算中的上帝》有类似之处。

    

  其中有很多好玩的细节,比如,引用《2001:太空奥德赛》和《银英传》的只言片语。印象最深的,是三体无人侦查器“水滴”击溃人类舰队的场面,为了描述三体世界明显高于人类的科技水平,举了一个程序员才能看懂的例子:

  ……无情杀戮在继续,随着四面逃窜的舰群间距的拉大,“水滴”很快把自己的速度增加到60千米/秒。在不间断的攻击中,它显示了冷酷而精确的智慧:追击路线完美地解决了邮差问题。这些精确测量和运算,都是在目标位置不断高速移动的情况下,不动声色地完成……

  邮差问题是NP-COMPLETE问题,目前还没找到多项式时间内结束的可行算法。当然,四十年来也没人证明它不可解。NP-COMPLETE问题若有突破,图灵奖是拿定了。我们pFind的肽到蛋白归并算法,本质上等同于二部图划分问题,就是一个NP-COMPLETE。

web2py和uliweb

  先来一幅hurryto的四格漫画,再说正事。

  Google发布GAE后,Python社区热闹起来。很多框架和开发界面在第一时间实现了对GAE的兼容。下面视频是web2py的演示。

  appspot.com上已经冒出了很多有趣的项目。特别推荐一下uliweb。国内最出色的Python开发者limodou在试用期就得到了GAE帐号。uliweb是他推出的又一个开源项目。小建议:像web2py一样制作更多视频,最好有中英文两个版本。教学video逐渐代替用户手册和帮助文档,这是潮流。(BTW:我们的pFind Studio套件各个工具都制作了演示视频,将在新版网站上公开)

著名书店和《九故事》

  1. 刚刚把Firefox升级到3.0 rc1试用一下,速度提升很明显,尤其是在Gmail这样JS代码很重的应用上。很多界面改进也很贴心。不过目前有些重要插件还不兼容,比如Google Gears和gladder。预计final版推出,就会解决。

     

  2. 向小秀推荐《布鲁克林的荒唐事》,他决定找来读一读,投桃报李,他又向我推荐正在读的《九故事》,这是塞林格在《麦田守望者》之后出版的第二本书。最初没听清名字,在豆瓣搜索,错找到了情色电影《9 songs》。昨天回家路上到光合作用买,照例在轻轨上读完第一篇,没太看明白,不过叙事很流畅,今天宅在家里把它读完。
  3. 刚刚注意到,小秀他们几个主要通过图书馆借书。挣工资好处就在于买书没有经济压力。记得本科时,不得不限制每月购书费用上限;而每次做软件项目打工挣来零花钱,除了连续N天请朋友们暴饮暴食涮羊肉,就是去西单图书大厦或海淀图书城大摞大摞往回搬(当然追女孩子的阶段是不同的);每到新学期,总得挑些书送人或扔掉,腾出柜子空间放课本。

     

  4. Gunshy豆瓣上搜集世界知名书店的照片,简直是梦幻,发誓这辈子一定要去一次。特此记录。

     

葡萄牙波尔图,莱罗书店

葡萄牙波尔图,莱罗书店

阿根廷布宜诺斯艾利斯,雅典人书店

阿根廷布宜诺斯艾利斯,雅典人书店

荷兰马斯特里赫特,教堂书店

荷兰马斯特里赫特,教堂书店

Google App Engine开放了

  好消息是,登录Google App Engine后,终于不再显示请等待审批的提示。开通帐号需要手机短信确认。

  坏消息是,兴冲冲建立第一个应用时,发现joyfire、我自己的姓名、pBuild和pLabel这些标识都已被抢了,我只抢回了pFind。哇啦哇啦。

  说到这个,感觉第二次网络创业热潮开始降温了。之前一两年,总有域名中介联系我,希望购买lehuo.comlehuo.net系列,单域名价格最高谈到三万。但是从今年春节以后,我就没有再接到这种电话了。看样子机会真来了,追求财务自由的虫子们,准备逢低吸纳

《布鲁克林的荒唐事》和《费城风云》

  开发进度比较顺利,不过没啥可记录的,全都是测试、代码审核和重构,繁杂琐碎的细节。我今天刚发邮件,把pFind 2.1 Beta1里程碑推迟到6月15日。

  今天到五道口“光合作用”买了保罗·奥斯特的《布鲁克林的荒唐事》易中天的《费城风云》。回来的轻轨上读完了前者的前两章,没走眼,是好书。(补:又搜索了一下,发现mindmeters上有一篇值得推荐的书评

    

  春节开始积累的购书小票总算到了500元,换来一张会员卡。除了买书打折,还可以在“光合作用”里的小咖啡馆获得优惠,任何咖啡买一送一。上次去还是年前的事。以后可以多找机会躲进去看书。其实无论“第三极”、“中关村图书大厦”、“海淀图书城”、“单向街”还是“光合作用”,即使有会员卡,打折幅度都不会比网上多。只不过,在密集的书架里淘书,喝着咖啡看刚买的新书,时时抬眼偷瞅旁边的mm,体验不同,更让人平静放松。

  交款时遇到一个法国大美女,想找人帮忙推荐“和孔夫子有关的书”,收款员mm居然找出两本中法文对照的鲁迅来。#@$%,汗,也算有关吧,里面有批判封建礼教的杂文。光合作用很多员工是勤工俭学的大学生吧,口语不错,总喜欢捉弄那些汉语磕磕绊绊,局促不安的老外。

哈利·波特

  现在看到了《火焰杯》,打算今天回去买《混血王子》。

  总是更喜欢性格怪异一点的角色。比如《哈利·波特》里的Luna LovegoodSeverus Snape,《老友记》里的Phebe、《银英传》里的奥贝斯坦和罗严塔尔……

  说到有个性,前两天外祖父的老战友去世借这个机会缅怀外祖父