Monthly Archives: October 2007

加班和躬身入局

  一整天才搞定一个BUG,规划好久的新流程总算基本调通了。初步测试效果相当令人振奋。加班回来晚了些,今天的节气是“霜降”,十点走出轻轨站,雾蒙蒙的。

  细节是魔鬼,所谓核心竞争力全在这儿。比如leo遇到的问题:理论上,蛋白理论酶切和肽序列统计排序是简单的算法,用STL的hash表就可以实现。但实际应用就没那么容易了,真正对付业界常用的蛋白质库,hash表里的海量数据一下就把32位进程的3G内存空间耗尽了。怎么重构,是外排、索引还是用AWE API实现自己的hash表?看来leo得踅摸两天了。

  要拥有比赛资格,就得面对细节和变化的挑战。曾国藩说:“在局外呐喊议论总是无益,必须躬身入局,挺膺负责,乃有成事之可冀”。拼凑一个根本不考虑2.0版的demo,几百个数据模拟一下,在论文里讲个好故事,不屑或不敢考虑实用?差得太远了。

798和五号线

  昨天去798工厂草草转了一圈,艺术的东西不好用文字和逻辑来准确描述,只是一种感觉,包括那一大片老式厂房的重构再生。这种感觉不错。 回来路上听朋友们聊天,哪有最新的话剧,哪有梅派嫡传弟子的京剧。

  总听到初来北京的亲友列举面对这个大都市的不习惯:高昂的生活费、拥堵的交通、飞涨的房价、激烈的竞争、冷淡的人际关系……老实说,我 到北京快十年了,其实仍然没完全适应,每次轻轨车厢里挤成沙丁鱼罐头,就狂郁闷。之所以还在死皮赖脸扛着,除了因为职业上的发展空间,还在于有机会体验各 种有趣的生活形态:可以去北图音乐厅参加不穿正装的音乐会,去三里屯和后海听摇滚,去实验剧场看话剧,去德云社听郭德纲相声,去798感受创意和思考,这 带来各种各样的惊喜和感受。

  五号线通了一周,作为直接受惠的天通苑居民,顶一下。至于更有观察力更有逻辑的,俺写不好,不如看看王正鹏的这篇BLOG

  一条铁路线能让北京的职业人群谈以为荣的一个城市时尚话题,是这些年来少见的。我只记得北京申奥成功后,很多人脸上 都写着这样快乐的表情。但在地铁五5号线上,很多漂亮的女孩都是面带微笑,认真地欣赏着这样一条地铁线路给人们生活带来的幸福感,并互相表达着赞美之 情……新加坡《联合早报》的记者前天在《一元钱的效应》这篇文章中对于北京市民有描述,作者这样写道:“我的耳朵里听到的是人们对于他们地铁和他们的国家的由衷的赞美和对于降价一块钱的由衷感谢”,他接着写道:“我强烈感觉到,至少就在这个真实的时刻里,有着人民与国家的互动,还有得来不易的满满信心”。

  当然老百姓思路简单实惠的多,北京台采访家住天通苑的上班族,50%以上给出的五号线带来自己的最大好处是:“多睡半个小时”

大服务的架构

  推荐一个关注高性能计算和Web服务的技术站点:http://highscalability.com。可以找到GoogleYouTubeAmazonFlickr这些世界上负载最大的在线服务的架构设计。

  当然,最受关注的依然是Google,那篇Google Architecture开头就这么说:

Google is the King of scalability……Their platform approach to building scalable applications allows them to roll out internet scale applications at an alarmingly high competition crushing rate。

  前一段时间Web2.0概念很热。确切说这不是一个技术概念,而是商业范畴。当然,很多新技术与Web2.0有密切关系,例如:AJAX、非EJB的J2EE、REST 风格的Web Services、敏捷开发的软件工程、在廉价PC集群上的超大规模分布式计算、多核和并行开发等等。程序员的学习趋势自然也由此决定,但无论网上社区的讨论、书店里的新书,还是真正形成创业的新应用,都是越靠近前端表现层越热,越到底层核心的地方就越缺少创意。

  这么多年下来似乎每个人都知道,在国内这个环境里创业,技术优势是不太可能形成核心竞争力的,屡试不爽的王道是依靠商业上运作来打通脉络。但这原则是永真的吗,也许中国的索尼正在几个年轻工程师的饭后闲聊里酝酿呢。索尼1960年代初创时的信条是:“改变Made in Japan在世界市场上质次价廉的形象,创造真正超前的产品”。

奇迹出现了

  在北京蛋白质研究中心这两周,掉进深坑又爬出来的感觉。pFind系统首次投入实际的一线生物科研,这是个里程碑。

  从第一天开始就不断出状况,几乎所有模块都面临没考虑到的选项。困难的“周全”程度,似乎是有意考验一遍团队里的每个成员。俺的最主要工作就成了不断呼叫“家里”火力支援,几乎把组里每个人都搬来呆了两天……

  28日deadline,我却不得不在15:00离开现场,去医院检查心脏。之前好些天胸闷,从27日开始胸口后背刺痛,影响到工作。 坐在出租车上打了几个电话,情绪低落。领导来电:”我判断不可能出现奇迹,别再指望了,安安心心去医院,先把身体情况搞清楚”。

  到医院请主任级专家看,结果心脏没事,肋间神经的问题,放射性的疼痛类似心脏症状。哈哈,长出一口气,这是长期坐在电脑前姿势不正,过于劳累造成的。

  晚上坐在电脑前反复刷邮件,等到21:00,按耐不住打电话过去,原来他们刚刚干完。给领导发短信:“奇迹发生了”。pFind终于跑 出了结果,帮生物学家得到了迄今为止公开报道的最好鉴定数字(当然,主要是人家的生化分析方法特别巧妙,pFind只是长长的实验分析链条的最后一环)。 发邮件给现场的四位大侠:“传说中的英雄,传说中的温酒斩华雄,哇啦哇啦……”

  今天又跑去。假期路上都没人了。看到了刚印好的精美Poster,生物学家们要在10月5日在韩国召开的HUPO 2007(第六届人类蛋白质组学大会)上公布这个结果。我在4月份写BLOG,希望有朝一日,pFind成为顶级刊物生物实验中的数据分析工具,也许这个愿望有机会实现了,比我预想的时间更早。

  贴张照片,背景是昂贵的LTQ-FT(线性离子阱-傅立叶变换离子回旋共振质谱仪)。超导的东东,强磁场能把附近的银行卡消磁。这几天刚好出问题,请了一位德国工程师来修,从下飞机就开始按小时计费。