Category Archives: 流水帐

记录一下

  这两天太戏剧化了。郁闷,开始疯狂备份

  昨天有人告诉我,新世纪找老婆要按下面的标准:上得了厅堂,下得了厨房,杀得了木马,翻得了围墙,开得起好车,买得起新房,斗得过二奶,打得过流氓。嗯,强大。

  Nature杂志刚发了一篇Publish or Perish in China(中国,发表还是灭亡)的文章。谈论中国学术造假的风气。前几天,The Lancet也发了一篇Scientific fraud: action needed in China(学术造假:中国需要采取行动)。有时候,还真怨不得人家歧视你

  发现live.com的Blog在Firefox下的一个BUG终于被修正了。我发现他们修正每个BUG的速度虽然算不上很快,但是始终保持一个节奏。这种细水长流不断改进,才是做产品最需要的。

  今天上午去北大开会,开到一半,有一只胖乎乎的黄猫闯进会议室,旁若无人地到处巡视。居然是传说中的“北大学术校猫”。cliu和它合了影,可惜马上轮到我上台讲PPT,没和明星学术猫照上相,遗憾。看来它爱好广泛,不止喜欢哲学,还喜欢计算机。

leo和hchi的倒排索引的文章被接收了!

  昨天起的就很早,一整天都在会场上偷着和瓶子双人编程;今天上午又要去对外交流,所以起床比昨天还早;下午把曙光5000A上的pFind并行版内核代码升级做完。Aho- Corasick算法代码遇到BUG,拖住hchi哥帮忙调试,天黑才放他走。我和瓶子等到很晚,测试完全正常才去吃饭。回来路上感觉特累,地铁里站着,心脏开始不规律地跳。21:00到家给hchi哥打电话,他还在路上呢。

  刚收到邮件。leo和hchi的倒排索引加速pFind蛋白质搜索引擎的论文被Rapid Communications in Mass Spectrometry接收。从07年痛苦摸索逐渐清晰,08年代码重构海量测试,09年申请专利反复投稿……倒排索引技术的研发一步步走来,纠结很多,故事很多,做得真很出色。俺虽然只是端茶送水摇旗呐喊的第三作者,同样超有成就感,万岁!这也是dq老大的IndexToolkit之后,pFind搜索引擎在索引算法上的又一个重大进展。

  前一阵hchi很疲惫,有次开会时私下和我聊天说:早上咳醒后,觉得自己快死了。最近两天他连续有deadline,我总担心他被拖垮。生活很公平,终究会在你最需要的地方,设置一个加油站点。去年1月7日刚好这篇论文诞生,颇符合hchi这个宿命论者的观点。

  我和瓶子的Rapid Communications in Mass Spectrometry投稿遇到点小问题,编辑粗心,把其他论文的审稿意见错发给我了。大概是圣诞节心不在焉吧。争取在一期期刊上,同时出现pFind 蛋白质搜索引擎的两篇加速文章,互相印证,那可就帅了。

  不管怎么说,大家注意身体。健康是1,其他的都是0。还要走很远,把pFind做成。

1月5日

  总结一下,09年总共发表了79篇BLOG。

  转眼贺仲雄教授去世两年了,时间过得飞快。他当年上课的很多话,现在才能真正体会。纪念老师。

  科学松鼠会刚发了一篇BLOG,介绍人类的无意识模仿行为的心理学和社会学常识。最后一段提到“夫妻相”,还贴了一张很可爱的插图。推荐。

暴雪和张小盒话剧

  上周五晚上,老娘和朋友视频聊天。突然杀到客厅来和我说:“我想去海南玩”。于是第二天就订了飞机票。公元2010年1月1日飞向温暖的南方。昨天打电话说,三亚只穿衬衣,跑到沙滩去玩,海水是温的。

  不得不佩服老太太的先见之明。她一走,北京就开始强降雪。

  本来pFind同伙们组织去香山玩真人CS。早上出门,小区里停车位都只能看到一个个大雪堆,路上全堵住了,于是只好回家,打电话给yjw美女说不去了。其他小孩还是去玩了。所谓年轻,就是在五十年一遇最低温,漫天飞雪不见停的情况下,依然兴致勃勃地跑去打露天游戏吧。

  原以为晚上的话剧也看不成了。到了下午雪渐小,天气预报说入夜后会停,又出门尝试。运气不错,一露头就遇到一辆黑的,顺利到了轻轨。花了三小时赶到王府井。东方先锋剧场平常都乌洋乌洋的,今天只坐了一半。话剧一开场,演员说:“刮风减半,下雨全完。这么大的雪,大家还来看我们的话剧,谢谢。”

  N年没看小剧场话剧了。上个月hchi哥和yjw美女去看《恋爱的犀牛》,回来模仿台词:“恋爱的‘恋’字,就是变态的‘变’的上半边,加上变态的‘态’的下半边”。回忆起在蜂巢、戏曲学院看《恋爱的犀牛》、《翠花上酸菜》还有更多实验话剧的乐趣。这次看的是张小盒话剧第三季《办公室有鬼之点头YES摇头 NO》。还不错。

  回来的路上很冷,地铁站里人还是很多,不少中年人在议论宋丹丹、濮存昕、徐帆在话剧《窝头会馆》里的表现。好像也是王府井,首都剧场。

  明天北京实施应急预案,学生都不上课。大家注意身体和安全。

  新年快乐。

这一期小姬看片会很好玩

  前瞻研究实验室年终考核。自己的总结一般般。倒是从别人的报告里收益不少。本想在BLOG上记录一些。周末在家始终无法正常访问live.com,刚刚才恢复。要休息了,稍后再说。长时间不更新BLOG很不好,所以上来随手敲点,想到哪里是哪里吧。

  2009科学嘉年华如火如荼。这一期的小姬看片会的主题是“爱情和性”,嘉宾里有动物所的科学家,也有老罗这样很好玩的老男人。推荐。科学松鼠会有文字版全文土豆有视频

  Tinyfool提高BLOG更新的频率了。为了证明真有订阅者“嗷嗷待哺”等着看BLOG,鼓励他坚持下去,不跳出来推荐一下不行呀。当然,他的分享本来就值得推荐。

  最近Resys第三次聚会的材料陆续放出来,更后悔没抢上名额了。个人很关注的是MPI和MapReduce的不同应用场合。上次Hadoop大会也听百度的工程师提过类似的话题。好像计算密集型的应用还是更适合MPI。明年我准备pFind实际对比一下。

  一年快过去了。私事稍后专门写BLOG。关于公共领域,发生了很多好的和坏的,有些事让人愤怒。不过我自己觉得还好。之所以保持乐观,是因为大家还拥有幽默感。无论网络、报刊、电视、短信,人们仍然在拿自己、拿这个社会开涮。下面这个链接是网易的年终总结。

  接下来一周(正确的说,是4天)打算努努力,让工作有些进展。

2012和韩寒

  2012?另据新华社消息,菲律宾政府20日将马荣火山的警戒级别由3级提升至4级。

  以前看过一个调查:如果即将世界末日,你要做什么?记得74%的男士选的是:“把单位里最漂亮的女孩扛回家”。韩寒的小说《一座城池》的结尾对此有更生动有趣的想象。我倒很好奇,除了打砸抢烧以外,谁还有啥更有创意的点子吗?

  说起韩寒,最早接触是《长安乱》,感觉文笔很成熟。后来又陆续读了《三重门》、《光荣日》和《一座城池》。前一阵子《新世纪周刊》因为他对公共事务的锐利直言,选他当2009封面人物。里面有一句话:“10年里,大家都各自老了一点,宽容了一点。”

流水帐.2009.12.14

  代码冻结了,不再check in任何新功能,只修改BUG,没完没了的BUG呀。

  前两天写到生日重复的概率科学松鼠会刚发表了一篇与相关BLOG:《生日悖论与生日攻击》

  今天给组里群发了一封邮件,题目是:像抢银行一样搞软件工程。号召大家努力创建professional的团伙。怎么回事呢,这里有一篇BLOG,介绍抢劫银行工程理论的创建。“所有可能性都要考虑到,一切意外都有预案。最专业的高手从不指望临场发挥,随机应变是外人看见的一种错觉。”,和软件工程没啥两样。

  Boss H得奖了。低调,居然没向俺们透露。还是瓶子哥无意中从清华大学网站搜索出来的。

生日和数学

  今天pFind组里两个人同时过生日。大家买了个黑森林蛋糕庆祝。

  吃蛋糕前,BOSS H问pFind组共17个人中出现生日重复的概率。我算的方式是1-(364/365)*(363/365)…*((365-16)/365),大概应该是31.5%,可能性还是蛮高的。

  然后切蛋糕,可吃蛋糕的次序怎么决定呢。于是玩猜数字游戏。屡战屡败,倒数第三个才吃上,哇哇哭。

  请寿星之一发表XX岁感言,他说:“XX是个素数。”

  怎么感觉像The Big Bang Theory里的情节?郑重声明:俺是正常的工程师,和这帮博士不是一伙的。

流水帐.2009.11.11

  压力很大,有段时间没有写BLOG的心境。修养不够,乱发火,还需要磨练,还需要反省,还需要成长。

  投稿Journal of Proteome Research,被传说中的副主编不经同行评审直接拒稿。yb打电话聊天,安慰:有些人就是怀疑,认为中国大陆做不出那么出色的科研成果。其实还好,还好。宁愿相信是自己做得还不够牛。即使真涉及技术外的因素,是不是歧视,取决于你最终到底做成什么样。姚明得分超过30,巴克利就该kiss驴屁股,否则人家就是有先见之明。短暂抑郁,转投Rapid Communications in Mass Spectrometry。这次遇到的责任编辑还是06年投稿的那位,很快就进入peer review了。fy老大催着赶紧申请专利,否则文章一发表,就来不及了。

  瓶子哥在曙光5000A上测试,320核条件下,加速效率达到80%。欣慰。这段时间的交流,意识到随着分布式规模的扩大,pFind集群的特点逐渐向I/O密集型靠拢。也就是说越来越像web搜索引擎。明年要搞点MapReduce的尝试。另外购买4000块的昂贵显卡。一直在关注GPU在科学界的应用。生物制药、物理航天、天气地质、游戏娱乐……短时间出现了爆炸性的增长。计算机行业的一个有趣的特点就是,工业界常常跑在前面,搞出一些破坏性创新,给学术界造成了很大的压力。

  雪下得好大,积雪没过了鞋帮,咯吱咯吱的。大家注意身体,别H1N1。今天见到了好久没联系的jw。原来是班车11点还因为大雪堵在路上,他索性下车到我们这里交流。忙过这一阵,要去看看朋友们。当然,还是会逼着大家给pFind引擎提意见。

  在各种场合听到关于创业的讨论。创业当然主要跟钱有关,但是必须有一点钱以外的东西。Boss H说得对,一时的热情最容易消散。必须有点功利以外的理由,让自己在最痛苦时平静下来,坚持下去。

  douban.com在测试“豆瓣电台”,根据你的历史行为推荐音乐。上来就给我推荐了几首没听过的张震岳、周杰伦和涅磐。查了查,豆瓣在招聘“算法和数据挖掘专家”。应聘要求包括:“热爱探索和钻研,相信算法能够改变人们的生活;极佳的逻辑分析能力和学习能力,善于应对各种智力挑战;熟悉海量数据处理和挖掘的基本算法, 或有高性能科学计算的相关经验”。

流水帐.2009.10.18

  1. 刚刚议论过“第二人生”科学松鼠会就发表了这么一篇好玩的《科学家网游不辍为哪般?》。(顺便推荐正在举办的科学嘉年华)。
  2. 高锟获得诺贝尔奖,网上出现了众多回忆和祝贺的BLOG,梁文道这篇《我的老校长高锟》最值得推荐。
  3. 最近我的这篇《出色的软件工程师什么样?》突然点击率很高,都是从搜索引擎过来的,关键字大多是“出色的软件工程师”,发生什么事了吗,望知情人告知。
  4. 张火丁又在举行演出,周五的《龙凤呈祥》还是很火爆,孙尚香出来的时候,宫女居然有12个之多,赶上国庆阅兵的排场了。今晚长安大戏院是《锁麟囊》。尽管票出来当天就被抢空了,我和老妈还是买到了两张580元的好座位。
  5. 老妈在网上认识一位“灯谜”,推迟自己的婚礼专门来看张火丁,他的座位恰好和我们挨着。老太太选择了自己精心收集整理的张火丁的各个时期的照片,刻录成光盘,作为贺礼,晚上见面送给人家。
  6. 13号轻轨沿线照明灯全部换成了太阳能加风力发电。新闻说,中国的太阳能领域产量已经占到了世界的1/3。狂热的太阳能、风能投资者正在西北五省广阔的戈壁滩上跑马圈地。这是一个雄心勃勃的产业。
  7. 今天是什么黄道吉日?到处都是婚礼和车队。网上说,张怡宁也是今天结婚。恭喜恭喜。