pFind集群的论文正式发表

  俺和瓶子的pFind集群论文:An efficient parallelization of phosphorylated peptide and protein identification已在英文期刊RAPID COMMUNICATIONS IN MASS SPECTROMETRY (2.772)正式发表。

  论文主要论述了我们在并行加速方面的研究。实验表明:pFind搜索引擎对一个含有100个Raw文件的磷酸化公共数据集进行鉴定,在100个处理器核 上,加速比为83.7;对另一个更大的、共含有1,366,471张质谱的磷酸化数据进行鉴定,在320个核上,加速比为258.9,加速效率达到 80.9%。

  目前pFind并行版已经投入一线分析实用。俺们正在千核条件下继续研发。

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