准备拽着2.1怪兽出去吓人

  刚刚改进了pFind 2.0的N端可变修饰生成的递归部分的代码,发布2.0.003补丁。

  五月份主要工作就是用pFind 2.0和pFind 2.1(流程2)进行大规模的伴随测试。经过对答案,两者都修正了不少BUG。pFind 2.1 Alpha 2估计会于下周一19日发布。我们会带着2.1去用户那里进行Beta测试,这比原计划提前了将近10天。

  fy领导的pFind M版也有进展,M是面向未来的版本,已经实现了对ETD的支持,多母离子窗口等梦幻特性。马上就要展开M版和2.1版(流程1 )伴随测试。

  按照计划,6月发布pFind 2.1 Beta 1。到7月底,在至少两家生物实验室完成Beta测试,8月8日,正式发布pFind 2.1的final release,“奥运献礼版”。另外,pFind 2.2也会很快着手,预计在12月1日发布,这就是这么多年传说中的集群版。

  最近压力很重,hchi昨天请病假,我还一直欠着pLabel和pScan的设计审阅和双人编程没空展开。不过也很有成就感,pFind 2.0陪着pFind 2.1跑了接近百万张质谱数据,每张谱、每个候选肽、每个打分、每个EV值……一直精确到小数点后五位,确保完全一样。有一次,18万张谱里只有1张不同,结果是1.000007对0.999998,但是hchi穷追猛打,一口气追下去,最终修正了一个很隐秘的BUG。

  pFind 2.1 Alpha2 目前还没有界面,8万行C++代码;pFind 2.0经过大规模整理删除,11万行C++代码;正在彻底重写的pLabel 2万行C++;等待大规模重构的pBuild,2万5千行C++;pScan接近1万行C++。这些代码都是在将近18个月里完成的。

  接下来这个夏天,拽着2.1怪兽出去吓人,把Mascot打得满地找牙。

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  1. Pingback: joyfire 王乐珩 » 发布pFind 2.1 Beta 2

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