昨天带着服务器安营扎寨,今天开始和生物学家们呆在一起。接下来的任务是请他们试用pFind,也跟着做实验打下手,了解了解需求。因为是在服务器上编代码,工作时间没办法上网。
先跑个最简单的,把牛血清标准蛋白的质谱数据扔进去,答案序列混在人的蛋白里当侯选数据库。请人家看了看结果,该搜出来的东西都有了。 这只能证明算法没大错,不表示能力有多强,后面还要经受混合上百种蛋白有修饰的真实实验的考验才算数。不管怎么说,第一次在实际用户面前亮相,也算初战告 捷。
瞧瞧人家搞生化的,白大褂胶皮手套,大小仪器瓶瓶罐罐,恒温恒湿的操作间,几百万的设备,到处是眼花缭乱的试管和仪器在闪烁,这才像传说中搞Science的样子。哪里像我们,就知道对着个方盒子敲啊敲,整个儿一打字员。
另一个区别是ppmm好多……不过胆子都好大……切开小白鼠眼不眨,处理剧毒药剂手不抖
下班,等实验室的mm带我去坐班车。她说“等我看看效果,站远一点,紫外线有污染”,看她也什么防护都没有,就大着胆子凑上去,人家也是人,我怕什么呢?“这是什么?”,“DNA”,“我只听过蛋白质电泳……”,“也有核酸电泳”,最后她关上紫外线灯,“结果不错。看样子你还挺感兴趣,下周帮我 作试验好了”,“那就变成添乱了”,“哪里,新手运气好,最难的两个克隆样本让给你”,汗……
OK,生物学家一天的工作就是这样的。
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