下午去军事医学科学院考察他们的集群硬件环境。IBM的刀片服务器,16个节点,每个节点2个CPU,2G内存,还有几十T的磁盘。完成人类基因组计划后,他们开始参与人类蛋白质组计划,俺们算法的直接客户。
无论Sequest还是Mascot,集群架构其实都差不多。
国内生物实验室的高通量质谱仪越来越多,有的一天得出的实验结果数据就好几十G,所以就需要与此向适应的处理鉴定能力。和生物仪器比起来,集群硬件和鉴定软件的价格对生物学家不算最大的投资。
生物信息学术会议上,一多半都是华人,我们与领域前沿的交流频繁程度并不逊色于任何人。开发自主的生物信息软件,科研实力并不是问题。在价格和服务反应上,相信本土开发者会更有优势。要说差距,也许就得在工程能力和科研成果孵化上考虑了。